もともと日本にいなかった生き物で、地域の自然に大きな影響を与える生物を特定外来生物といいます。県内ではアライグマ、カミツキガメ、ブラックバスなどの動物、またオオキンケイギクなどの植物が確認されています。特定外来生物ではありませんが、生態系被害防止外来種に指定されているアメリカオニアザミも確認されています。
秩父市では、埼玉県の「アライグマ防除計画」に同意し、アライグマの捕獲を行っています。
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